ネタバレ有＊WOWOW｢フィクサー Season2｣全話あらすじ･感想･キャスト･予告動画

東京都知事の横宮三郎（石黒賢）に、東京湾の埋め立て事業に関する不正疑惑が浮上する。マスコミ宛てに送られた「横宮都知事は秘密裏に東京湾埋立事業を進めている。浜潮建設から不正献金を受け、見返りに発注した」というメールが発端だった。
記者の渡辺達哉（町田啓太）に疑惑を追及された横宮は、乱闘騒ぎを起こして釈明会見をする羽目に。総理の新田さゆり（富田靖子）は次期都知事選における横宮の再選を懸念するが、横宮と深い繋がりを持つ須崎幹事長（小林薫）は「そのうち鎮火する」と楽観する。
ある夜、渡辺は横宮から電話で呼び出され、彼が滞在しているホテルを訪れる。だが部屋の中に横宮の姿はなく、彼の妻・妃呂子（真飛聖）が頭から血を流して倒れていた。助けようとした渡辺の前に横宮が現れ、渡辺は殺人未遂で任意同行を求められる。
警察の取り調べに対し、渡辺は横宮からインタビューに答えたいという電話をもらったと説明するが、横宮は電話で二度と取材には答えないと告げたと言い、両者の供述が食い違う。
渡辺達哉が起訴されたことを知った設楽拳一（唐沢寿明）は、キャスターの沢村玲子（内田有紀）を介して元検事の敏腕弁護士・杉谷菜穂子（鈴木保奈美）を破格の報酬で雇う。なぜ渡辺を助けるのかという菜穂子の問いに、設楽は担当検事が佐々木雪乃（江口のりこ）だからだと答える。雪乃はかつて拳一を刑務所に送った検察官だった。
その頃、本郷吾一（西田敏行）の邸宅では、本郷と須崎、そして浜潮建設社長・氏原巧巳（加藤雅也）らが東京湾の埋立工事に関する計画を話し合っていた。横宮都知事が再選しなければ計画は白紙になるのでは、と懸念する氏原に、本郷は「私は何も心配してない」と豪語する。本郷は検事の雪乃に電話し、「しっかり追及してくれ」と頼む。
渡辺は必死に無実を訴えるが、雪乃は聞く耳を持たない。渡辺の逮捕に納得がいかない刑事の板倉（小泉孝太郎）は、担当刑事の中条真（久世星佳）に協力を求められ、捜査に加わることに。
渡辺達哉の母・響子（斉藤由貴）は、設楽が滞在するホテルを訪ねて面会する。そして同情ならば結構です、と援助を拒む。設楽は同情ではなく、見どころがある達哉を失うのは惜しいからだと説明する。
意識不明の重体だった妃呂子が意識を取り戻す。雪乃はすぐさま病院に駆けつけ、事情聴取を行うことに。妃呂子は夫である横宮の顔色を伺いながら、渡辺に殴られたと供述する。

横宮妃呂子の証言により、渡辺達哉は殺人未遂で起訴される。妃呂子が入院する病院で働く達哉の母・響子は、裁判が終わるまで休暇を取るよう院長から通告される。
設楽は新田総理と密会し、都知事選に新田の顔を立てる最適な候補者を立てると約束する。その候補者とは、キャスターの沢村玲子だった。設楽に呼び出され、突然「都知事選に立候補しないか」と持ちかけられた玲子は困惑する。
設楽は渡辺と面会し、自分が情報提供者「Ｋ」であることを明かす。そして都知事が絡む事件の冤罪を晴らすことは、自分にとって大きなリターンがあると告げる。諦めかけていた渡辺は、設楽との面会で戦う気持ちを取り戻す。
弁護士の杉谷菜穂子は、かつて検事の佐々木雪乃と同じ東京地検刑事部に所属していた。後輩である雪乃の強引な捜査を見かねて注意したところ、上司から干渉するなと叱責され、処分を受けたという。菜穂子はそんな組織に嫌気がさして検察を辞めたのだった。
設楽は雪乃が民自党がらみの事件を多く担当していることから、今回の渡辺の事件を彼女が担当することは偶然ではないと考えていた。そこで秘書の丸岡慎之介（要潤）に雪乃の素性を調べるよう命じるが、彼は表面的な調査しかしない。
丸岡を怪しんだ菜穂子は、設楽に忠告する。設楽は丸岡を試すために「渡辺は誰にも明かしてない証拠を握っている」という偽情報を与えて相手の出方を見ることに。
丸岡は本郷が送り込んだスパイだった。丸岡から報告を受けた本郷は、須崎や雪乃と情報を共有する。雪乃は本郷の娘であり、丸岡とは家族同然の関係だった。
刑事の板倉は、事件現場となったホテルの防犯カメラを調べ、事件当日に見覚えのある男がホテルにいたことを突き止める。その男は以前暴力団にいた半グレで、現在は本郷のもとで働いていた。
渡辺達哉の初公判当日。玲子は裁判の行方よりも視聴率を重視する報道番組にうんざりし、次期都知事選に立候補する考えを強めていく。設楽はこの裁判が都知事選の代理戦争になることを彼女に告げる。
渡辺は法廷で起訴内容を全面否定する。そしてこの事件には裏があり、横宮都知事が関係していると暴露する。雪乃は次回の公判に横宮都知事の出廷を申請する。

次回公判の証人として横宮都知事の出廷が決まる。どんな証人が来ようと無実を訴える方針に変更はないと断言する菜穂子に、渡辺は「真実を暴いて俺を信じなかった世間を見返してやる」と息巻く。響子は設楽の影響を受けて傲慢になった息子を案じ、設楽の支援には何か別の理由があるのかもしれない、と菜穂子に伝える。
板倉は本郷邸を監視し、事件現場の防犯カメラに映っていた男が本郷の使用人リュウであることを突き止める。さらに検事の佐々木雪乃が本郷と養子縁組をしていることを知り、設楽に報告する。本郷は養護施設に寄付をする一方で、優秀な子供を見つけては養子縁組をし、教育を受けさせて各界に送り込んでいるのだった。
少年院あがりの丸岡も、本郷に身元を引き受けてもらったのだろうと推測する設楽。丸岡が自分を監視するために送り込まれたスパイだと気づいた設楽は、このまま騙されたふりを続け、先方の動きを操ることに。
設楽から次期都知事選の候補者として沢村玲子を紹介された新田総理は、須崎幹事長を呼び出し、自分が都知事選の候補を立てると宣言する。彼女の後ろに設楽の影を感じた須崎は、設楽に連絡して探りを入れる。設楽は須崎の弱みである佐久田薬品との密約の音声データをちらつかせ、データを引き渡す条件として立会人に本郷を指名する。
渡辺達哉の第２回公判当日。本郷邸に呼ばれた設楽は、須崎と本郷の前で持参した音声データを再生する。データは間違いなく本物だった。設楽はデータを渡す代わりに横宮妃呂子を襲った凶器を返してほしいと持ちかける。本郷は事件への関与を否定し、交渉は決裂するが、「もし凶器が私の元にあれば渡す」と告げる。
検察側の証人として、横宮都知事が出廷する。横宮は「妻の悲鳴を聞いて部屋に駆け込んだら、妻が倒れ、被告人がそばにいた」と証言する。雪乃は次回の公判で新たに見つかった証拠を提出したいと発言。それは渡辺の指紋がついた凶器だという。
板倉は事件現場に居合わせたホテルの従業員と会い、本当に横宮妃呂子の悲鳴を聞いたのかと問い詰める。その様子を、リュウが離れた場所からうかがっていた。
設楽は本郷がこういう形で凶器を返してきたことに触れ、「向こうも後がないということだ」と丸岡に告げる。そして幼い頃、「ヒーローになりたいなら政治家になれ。日本を乗りこなすんだ」と本郷に言われたことを話す。

凶器に使われたワインオープナーが、事件現場の真下に位置する貯水タンクの下から発見された。凶器を包んでいたナプキンからは渡辺の指紋が検出され、被害者の横宮妃呂子も「ワインオープナーで殴られた」と証言する。
絶望的な状況に追い込まれた渡辺は、自暴自棄になり罪を認めようとする。菜穂子は渡辺を奮い立たせるため、殿村元総理の事件で父親の無実を訴え続けた沼田由里（吉川愛）と会わせることに。由里の言葉に励まされた渡辺は、再び戦意を取り戻す。
新田総理は次期都知事選にキャスターの沢村玲子を立てると宣言。それを聞いた須崎は予想外な人選に焦るが、本郷から玲子がかつて殿村の愛人だったことを知らされ、新田にその事実を伝えて困惑させる。
刑事の板倉は、横宮妃呂子を襲った真犯人は横宮都知事だと考えていた。設楽はウソをついている横宮妃呂子とホテルの従業員の両方に揺さぶりをかけることを提案。板倉はホテルの従業員に会い、「横宮妃呂子が真実を話せば、あなたは偽証罪に問われる」と話す。
設楽は横宮妃呂子に会うため、彼女の信頼を得ている玲子に仲介を頼む。玲子と面会した妃呂子は、設楽が真犯人を知っていると聞いて動揺する。
事件当日、妃呂子は夫と口論になったことを思い出す。発端は、妃呂子がマスコミ宛に例の怪文書を送ったことを打ち明けたことだった。「あなたに都知事の資格はない。須崎幹事長の人形にすぎない」と妃呂子に罵倒された横宮はカッとなり、妃呂子ともみ合いになった末、ワインオープナーで殴ったのだった。
第３回公判が開かれ、渡辺は凶器を包んでいたナプキンに触れたことを証言する。止血するために、とっさに妃呂子の傷口にナプキンをあてたのだ。それは母・響子から何度も教わった救命措置のひとつだった。
渡辺はあらためて無実を主張し、「この事件には何者かの思惑が働き、検察はそれに手を貸している」と発言する。
雪乃は自分が信じる真実が間違っているのではないかと疑い始め、養父である本郷を問い詰める。本郷は事件の真犯人が別にいることを明かしたうえで、「その犯人を捕まえればこの国にとって大きな損失が生まれる」と告げる。
妃呂子は設楽と会うことを決意する。設楽は病院へ向かう前、丸岡に「俺が横宮妃呂子に会うのを本郷に報告するのは少し待ってくれ」と頼む。
設楽が妃呂子の病室を訪れるよりも先に、本郷の使用人リュウが彼女の前に姿を現す。身の危険を感じて逃げようとする妃呂子だったが、そこへ丸岡が現れ…。

設楽は横宮妃呂子の病室を訪れ、丸岡がリュウを連れ去り妃呂子を助けたことを知る。彼女を守るため、設楽は妃呂子を病院から連れ出してホテルに匿う。妃呂子は夫である横宮都知事との離婚を決心し、菜穂子に事件の真相を語る。
妃呂子が病院から姿を消したことを知った須崎は、横宮を見限り、辞表を提出するよう命じる。横宮は自殺を試みるが実行できず、途方にくれる。妃呂子を殴ったとき、横宮は彼女が死んだと思い込み、須崎に連絡して指示を仰いだのだった。
玲子と殿村の関係を知った新田総理は激怒し、「もう都知事選には口を挟めない」と設楽に告げる。玲子は出馬を諦め、この裁判を最後に番組を降りる決意をする。
雪乃は本郷から渡辺を陥れた理由を知らされ、罪悪感に苦しむ。進むべき道に悩む彼女に、設楽は「あなたがやるべきことは一つ。自分の正義を見つけることです」と助言する。
渡辺の４回目の公判が開かれる。雪乃は論告で渡辺の無罪を告げ、事件の再捜査をすべきだと結論づける。そして自らの責務を果たすため、事件に関与した人物や組織を公正かつ真摯な捜査で究明すると誓う。
丸岡は設楽のもとを去るが、本郷から設楽を始末するよう拳銃を渡され、設楽を呼び出す。丸岡の意図に気づいた設楽は「お前に殺されても仕方ない」と覚悟を決めるが、丸岡は引き金を引くことができなかった。
設楽は本郷の屋敷を訪ね、丸岡はもう戻らないと告げて銃を返す。検察の捜査に応じるよう勧める設楽だったが、本郷は「坊主、日本を乗りこなせ」と設楽に告げて目の前で拳銃自殺を図る。
本郷の遺体を確認し、自分が殺したのではないかと自問する雪乃。だが検察を辞めるのかと聞く菜穂子に、「本郷のやってきたことを徹底的に追及したい。それが父への恩返しだと思ってる」と決意を語る。満足気に立ち去る菜穂子に、深々と頭を下げる雪乃。
釈放された渡辺は、画廊を訪れて設楽に礼を言う。30歳になった渡辺に、設楽は都知事選に出馬しないかと持ちかける。
帰宅した渡辺は、母・響子から設楽が実の父親であることを打ち明けられる。響子が設楽のもとを去ったのは、達哉が設楽の影響を受けて危険な目に遭うことを恐れたためだった。だが達哉を育てるうちに、息子もまた何かを変えようとせずにはいられない人間なのだと気づいたのだった。
真実を知った渡辺は設楽の部屋を訪れる。だがそこで待っていたのは、須崎幹事長だった。設楽は須崎を次期総理の座に就かせる代わりに、都知事選に協力する約束を取り付けたのだ。困惑する渡辺だったが、設楽にうながされ、迷いつつも須崎と握手する。